Первые попытки не инъекционного введения аллергенов в ходе специфической иммунотерапии (перорального, интраназального, бронхиального) были недостаточно эффективны либо характеризовались высоким риском осложнений. До 1986 года инъекционная аллерген-специфическая иммунотерапия являлась стандартным методом лечения аллергических заболеваний. Ситуация изменилась в 1986 году, когда Британский комитет по безопасности лекарственных средств сообщил о нескольких смертельных случаях, вызванных инъекционной АСИТ, и выразили обеспокоенность по поводу безопасности и соотношения польза/риск при использовании данного метода.
Аллергологи усилили поиски альтернативных вариантов иммунотерапии, не требующих регулярных инъекций. Наиболее перспективным методом оказалась сублингвальная иммунотерапия (СЛИТ).
В 1993 году Европейская академия аллергии и клинической иммунологии (European Academy of Allergology and Clinical Immunology — EAACI) в официальном документе указала на необходимость тщательного исследования эффективности и безопасности сублингвальной иммунотерапии. В 1998 году авторитетной организацией — Всемирной организацией здравоохранения, на основании данных многочисленных исследований, было заявлено, что сублингвальная иммунотерапия — перспективный метод, который может стать альтернативой инъекционной иммунотерапии. В результате ряда клинических испытаний спустя 3 года в руководстве ARIA (международная инициатива, способствующая внедрению современных эффективных методов лечения аллергического ринита и астмы) метод сублингвальной специфической иммунотерапии был рекомендован для лечения сезонного и круглогодичного аллергического ринита у взрослых и детей.
В обновленном руководстве 2008 года указывается на целесообразность применения метода СИТ в лечении некоторых форм бронхиальной астмы; при этом отмечается более высокая безопасность сублингвальной специфической иммунотерапии в сравнении с инъекционной.
В 2009 году Международная организация по проблемам аллергии (World Allergy Organization — WAO) опубликовала документ, который документирует эффективность сублингвальной иммунотерапии, сравнимую с эффективностью инъекционной СИТ, и безопасность сублингвальной иммунотерапии, превосходящую таковую при инъекционной СИТ.